ประสิทธิภาพการกระจายความร้อนของหม้อน้ำระบายความร้อนด้วยน้ำเป็นสัดส่วนโดยตรงกับอัตราการไหลของของเหลวทำความเย็น (น้ำหรือของเหลวอื่น ๆ ) และอัตราการไหลของของเหลวสารทำความเย็นสัมพันธ์กับกำลังของปั๊มน้ำของระบบทำความเย็น อีกทั้งความจุความร้อนของน้ำมีมาก ซึ่งทำให้ระบบทำความเย็นแบบระบายความร้อนด้วยน้ำมีความจุความร้อนได้ดี ซึ่งเทียบเท่ากับระบบระบายความร้อนด้วยอากาศถึง 5 เท่า และข้อดีโดยตรงคือกราฟอุณหภูมิการทำงานของ CPU จะแบนราบมาก ตัวอย่างเช่น ระบบที่ใช้หม้อน้ำระบายความร้อนด้วยอากาศจะพบกับอุณหภูมิที่เพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็วในช่วงเวลาสั้นๆ เมื่อรันโปรแกรมที่มีโหลด CPU จำนวนมาก หรืออาจเกินอุณหภูมิที่เตือน CPU อย่างไรก็ตาม ระบบระบายความร้อนด้วยน้ำมีความผันผวนทางความร้อนค่อนข้างน้อยเนื่องจากมีความจุความร้อนสูง ล้นหลาม.
จากมุมมองของหลักการกระจายความร้อนในการระบายความร้อนด้วยน้ำ มันสามารถแบ่งออกเป็นสองประเภท: การระบายความร้อนด้วยน้ำแบบแอคทีฟและการระบายความร้อนด้วยน้ำแบบพาสซีฟ นอกเหนือจากการมีอุปกรณ์เสริมทั้งหมดของหม้อน้ำระบายความร้อนด้วยน้ำแล้ว ระบบระบายความร้อนด้วยน้ำแบบแอคทีฟยังจำเป็นต้องติดตั้งพัดลมระบายความร้อนเพื่อช่วยในการกระจายความร้อน ซึ่งสามารถปรับปรุงผลการกระจายความร้อนได้อย่างมาก
การระบายความร้อนด้วยน้ำแบบพาสซีฟไม่ได้ติดตั้งพัดลมระบายความร้อนใดๆ และอาศัยหม้อน้ำระบายความร้อนด้วยน้ำเพื่อกระจายความร้อนเท่านั้น อย่างมากก็จะมีการเพิ่มแผงระบายความร้อนบางส่วนเพื่อช่วยกระจายความร้อน วิธีการระบายความร้อนด้วยน้ำนี้มีประสิทธิภาพน้อยกว่าการระบายความร้อนด้วยน้ำแบบแอคทีฟ แต่สามารถบรรลุผลที่เงียบสนิท
อุณหภูมิสูงไม่เพียงแต่จะทำให้ระบบทำงานไม่เสถียร ลดอายุการใช้งานลง แต่ยังอาจทำให้ส่วนประกอบบางส่วนไหม้ได้อีกด้วย ความร้อนที่ทำให้เกิดอุณหภูมิสูงไม่ได้มาจากภายนอกคอมพิวเตอร์ แต่มาจากภายในคอมพิวเตอร์ หน้าที่ของหม้อน้ำคือการดูดซับความร้อนนี้และตรวจสอบให้แน่ใจว่าอุณหภูมิของส่วนประกอบคอมพิวเตอร์เป็นปกติ หม้อน้ำมีหลายประเภท CPU, กราฟิกการ์ด, ชิปเซ็ตมาเธอร์บอร์ด, ฮาร์ดไดรฟ์, แชสซี, พาวเวอร์ซัพพลาย และแม้แต่ออปติคัลไดรฟ์และหน่วยความจำ ล้วนต้องการหม้อน้ำ ไม่สามารถผสมหม้อน้ำที่แตกต่างกันเหล่านี้ได้ และหม้อน้ำ CPU ที่พบบ่อยที่สุด - วิธีการกระจายความร้อนแบบแบ่งย่อยสามารถแบ่งออกเป็นการระบายความร้อนด้วยอากาศ, ท่อความร้อน, การระบายความร้อนด้วยน้ำ, เครื่องทำความเย็นเซมิคอนดักเตอร์, เครื่องทำความเย็นคอมเพรสเซอร์ ฯลฯ